La collection zoologique, bien que numériquement peu développée, permet d’avoir un aperçu de la faune mayennaise, mais également d’observer des espèces aujourd’hui disparues du territoire. Elle compte près d’une centaine de mammifères et environ 600 oiseaux naturalisés, un ensemble d’œufs des principales espèces des environs, des reptiles, des batraciens, des poissons, des insectes en tout genre, ainsi qu’environ 7000 coquillages divers et variés. Il est également possible de noter la présence de quelques d’arachnides, de cnidaires, ou encore d’annélides, mais dans des proportions bien plus faibles.